Поиск нефтяных и газовых месторождений в Калининградской области начался в середине 50-х годов прошедшего столетия. Первое нефтяное месторождение на суше Калининградской области — Красноборское — открыто в 1968 году. Первый эшелон нефти, добытой на Красноборском месторождении, отправлен на нефтеперерабатывающий завод 14 февраля 1975 года.
Предприятие вошло в состав Группы «ЛУКОЙЛ» в 1995 году.
Проекты, реализованные ЛУКОЙЛ-Калининградморнефть, внесли весомый вклад в развитие газонефтедобывающей отрасли России. Так, с 2004 года предприятие ведет разработку крупнейшего в Балтийском море Кравцовского месторождения. Для добычи нефти на этом месторождении ЛУКОЙЛ-Калининградморнефть построил первую в стране морскую ледостойкую стационарную платформу.
В разные периоды развития предприятия добыча нефти была главным, но не единственным направлением его деятельности. В силу особого, полуэксклавного, положения, в котором Калининградская область оказалась в 90-е годы, наиболее удобной и экономически оправданной формой развития нефтяного бизнеса стала диверсификация производства. Так в структуре предприятия появились сервисные, сбытовые и транспортные подразделения. Сегодня все они существуют под новыми наименованиями, но продолжают вести прежнюю деятельность и по праву считаются преемниками традиций калининградской нефтяной отрасли.
1995—2002 годы
Вхождение в состав Группы «ЛУКОЙЛ» в качестве дочернего общества «ЛУКОЙЛ-Калининградморнефть».
Сдача в эксплуатацию комплексного нефтяного терминала на берегу Калининградского морского канала для приема, хранения и отгрузки нефти и нефтепродуктов на танкеры для отправки на экспорт.
Создание цеха производственного обслуживания для ремонта нефтепромыслового оборудования.
2003 год
Создание управления по реализации нефтепродуктов марки «ЛУКОЙЛ», сопутствующих товаров и услуг на территории Калининграда и области.
Сдача в эксплуатацию газонаполнительной станции, которая на половину закрыла потребности регионального рынка в сжиженном газе и позволила предприятию экспортировать смеси сжиженных газов.
Начало многолетней программы производственного экологического мониторинга при обустройстве и эксплуатации нефтяного месторождения Кравцовское (D-6) в Балтийском море.
2004—2006 годы
Начало эксплуатационного бурения с платформы D-6 в Балтийском море. Получение первой балтийской нефти с морской ледостойкой стационарной платформы, расположенной на месторождении Кравцовское (D-6).
2007—2009 годы
Завершение строительства стационарного морского ледостойкого отгрузочного причала для Варандейского терминала в Баренцевом море.
Участие в проекте обустройства нефтяного месторождения им. Ю. Корчагина в Каспийском море (строительство жилого модуля с вертолетной площадкой и переходного моста).